ಉತ್ಪನ್ನಗಳು

ಪ್ರೊಟೀನ್ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ನೆಟ್‌ವರ್ಕ್‌ಗಳ ಅಗಾಧವಾದ ಸಂಕೀರ್ಣತೆಯಿಂದಾಗಿ ಪ್ರೋಟೀಮ್-ವೈಡ್ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಘಟನೆಗಳ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಇನ್ನೂ ಪ್ರಮುಖ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾತ್ಮಕ ಸವಾಲಾಗಿದೆ.ಈ ಕೆಲಸದಲ್ಲಿ, ಫಾಸ್ಫೋಪ್ರೊಟಿಯೋಮ್‌ನ ಜಾಗತಿಕ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗೆ ಕೊಡುಗೆ ನೀಡುವ ಸಾಮರ್ಥ್ಯಕ್ಕೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದಂತೆ ನಾವು Lys-N, Lys-C ಮತ್ತು ಟ್ರಿಪ್ಸಿನ್‌ಗಳ ಪೂರಕತೆಯನ್ನು ಮೌಲ್ಯಮಾಪನ ಮಾಡುತ್ತೇವೆ.N-ಟರ್ಮಿನಲಿ ಅಸಿಟಿಲೇಟೆಡ್, ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಟೆಡ್ ಮತ್ತು ಮಾರ್ಪಡಿಸದ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳನ್ನು ಪರಿಣಾಮಕಾರಿಯಾಗಿ ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲು ಕಡಿಮೆ-pH ಪ್ರಬಲ ಕ್ಯಾಶನ್ ವಿನಿಮಯದ ಸಂಸ್ಕರಿಸಿದ ಆವೃತ್ತಿಯನ್ನು ಬಳಸಲಾಯಿತು.ಮೂರು ಕಿಣ್ವಗಳ ಸಂಯೋಜನೆಯನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು 1 ಮಿಗ್ರಾಂ ಪ್ರೊಟೀನ್‌ನಿಂದ <1% ತಪ್ಪು ಪತ್ತೆ ದರದೊಂದಿಗೆ ಒಟ್ಟು 5036 ಅನಗತ್ಯ ಫಾಸ್ಫೋಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಬಹುದು.ವಿಭಿನ್ನ ಪ್ರೋಟಿಯೇಸ್‌ಗಳೊಂದಿಗೆ ರಚಿತವಾದ ಫಾಸ್ಫೋಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಡೇಟಾ ಸೆಟ್‌ಗಳ ನಡುವಿನ ಅತಿಕ್ರಮಣವು ಅತ್ಯಲ್ಪವಾಗಿದೆ ಎಂದು ನಮ್ಮ ಡೇಟಾವು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಿದೆ, ಆದರೆ ಅದೇ ರೀತಿ ರಚಿಸಲಾದ ಎರಡು ಟ್ರಿಪ್ಟಿಕ್ ಡೇಟಾ ಸೆಟ್‌ಗಳ ನಡುವಿನ ಅತಿಕ್ರಮಣವು ಕನಿಷ್ಠ 4 ಪಟ್ಟು ಹೆಚ್ಚಾಗಿದೆ ಎಂದು ಕಂಡುಬಂದಿದೆ.ಈ ರೀತಿಯಾಗಿ, Lys-N ಮತ್ತು ಟ್ರಿಪ್ಸಿನ್‌ನ ಸಮಾನಾಂತರ ಬಳಕೆಯು ಪತ್ತೆಯಾದ ಫಾಸ್ಫೋಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಯಲ್ಲಿ 72% ಹೆಚ್ಚಳವನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸಿತು, d ಅನ್ನು ಟ್ರಿಪ್ಸಿನ್‌ಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ, ಆದರೆ ಟ್ರಿಪ್ಸಿನ್ ಪ್ರತಿಕೃತಿ ಪ್ರಯೋಗವು ಕೇವಲ 25% ಹೆಚ್ಚಳಕ್ಕೆ ಕಾರಣವಾಯಿತು.ಹೀಗಾಗಿ, ಟ್ರಿಪ್ಸಿನ್ ಮತ್ತು ಲೈಸ್-ಎನ್ ಡೇಟಾದ ಮೇಲೆ ಮಾತ್ರ ಕೇಂದ್ರೀಕರಿಸಿದಾಗ, ನಾವು 4671 ಅನಗತ್ಯ ಫಾಸ್ಫೋಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಿದ್ದೇವೆ.ಪತ್ತೆಯಾದ ಸೈಟ್‌ಗಳ ಹೆಚ್ಚಿನ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಲೈಸ್-ಎನ್ ಮತ್ತು ಟ್ರಿಪ್ಸಿನ್ ಡೇಟಾ ಸೆಟ್‌ಗಳು ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿ ವಿಭಿನ್ನವಾದ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಮೋಟಿಫ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಪುಷ್ಟೀಕರಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಿದೆ, ಫಾಸ್ಫೋಪ್ರೊಟಿಯೋಮ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳಲ್ಲಿ ಮಲ್ಟಿಪ್ರೊಟೀಸ್ ವಿಧಾನಗಳು ಬಹಳ ಮೌಲ್ಯಯುತವಾಗಿವೆ ಎಂದು ಮತ್ತಷ್ಟು ಸಾಬೀತುಪಡಿಸುತ್ತದೆ.